秘鲁海关实行国际商品协调制度编制关税税则，实行多栏税率，对安第斯共体国家有统一关税安排，与南共市国家也有协定关税。秘鲁现行关税为从价税，税率分为3个等级，即商品进口到岸价（CIF）的0%、6%、11%，名义平均关税为3.2%。大部分税号的产品都已实行零关税，主要是资本货物、原材料等。对奢侈品征收较高的选择性关税。快递商品的税率为4%。需要注意的是，除关税外，进口商品还需要缴纳18%的一般销售税（IGV），部分产品（如奢侈品）还需缴纳选择消费税。秘鲁产品出口没有关税。
秘鲁从中国进口产品执行两国自贸协定规定的税率，详情可到有关网站上查询，如中国自由贸易服务网（fta.mofcom.gov.cn/inforimages/2009 04/20090429090501935.pdf）和秘中商会（www.capechi.org.pe/pdfs/ Anexo_Oferta_Peru_espanol.pdf）。
需要注意的是，秘鲁对中国凉鞋和凉拖鞋、拉链、滑水板、不锈钢餐具、部分棉纺和混纺织物、涤棉府绸、棉机织物和牛仔布等商品征收反倾销税。