立陶宛加入欧盟后，对外资实行国民待遇，入盟前的一些税收优惠皆被取消，仅在自由经济区还实行部分税收优惠。根据《立陶宛共和国自由经济区基本法》，所有自由经济区享受税收优惠，入驻企业实际投资额达到100万欧元以上，享受前6年免公司所得税（立陶宛境内的公司所得税为15%），后10年减半征收（即按7.5%征收）待遇。同时，免不动产税、红利税。园区内的土地租用期为49年（最早建立的考纳斯自由经济区、克莱佩达自由经济区的土地租用期为99年，园区内不动产不能永久出售，但可长期租赁。
立在全国主要经济地区建有7个自由经济区，分别是克莱佩达自由经济区、考纳斯自由经济区、首莱自由经济区、帕尼韦日斯自由经济区、凯代尼艾自由经济区、马里亚姆波列自由经济区和阿克米亚内自由经济区。目前，立已宣布将在首都维尔纽斯建立一个新的自由经济区。克莱佩达港靠近克莱佩达自由经济区、考纳斯自由经济区与考纳斯机场近在咫尺，是立条件最好的两个自由经济区，招商局集团已经与这两个经济区签订合作意向书。
一、克莱佩达自由经济区
克莱佩达自由经济区是立陶宛国家重点经济区，为立陶宛最早和最大的经济开发区。主要情况如下：
1、基本情况
位于立陶宛唯一的港口城市克莱佩达东部，距离港口约3公里。2002年建立，占地面积为412公顷，目前入住企业119家，主要来自英国、爱尔兰、泰国、芬兰、丹麦、日本、挪威、瑞士、白俄罗斯、乌克兰以及立陶宛本国企业，吸引投资5.88亿欧元，创造就业岗位4000多个。2015年入住企业年销售额总计8.26亿欧元，出口5800万欧元。
2、管理模式
克莱佩达自由经济区为国家所有，由克莱佩达自由经济区公司负责运营，拥有99年使用权。管理公司主要股东为波罗的海基金投资股份公司、PierreJean Everaert个人、SLEZ VB股份公司以及日奥留银行等。
3、主要产业
克莱佩达自由经济区的主要产业包括汽车、食品加工、能源、塑料、物流包装以及机械设备
二、考纳斯自由经济区
1、基本情况
考纳斯自由经济区位于立陶宛第二大城市考纳斯，紧邻考纳斯机场，距克莱佩达港口100公里。规划面积534公顷，2003年正式运营，目前入住企业24家，70%为外商投资企业，创造就业岗位2000多个。累计吸引投资3.67亿欧元。
2、管理模式
比利时AOI NV公司通过招标获得考纳斯自由经济区经营权，与立政府签订为期99年的土地租用协议，并成立考纳斯自由经济区管理公司，负责园区运营和管理工作。
3、主要产业
工业自动化、飞机维修、仓储物流、制药生产、食品加工、家具加工、化工、电子生产等。
三、其他自由经济区
1、首莱自由经济区面积218公顷，区内规划和环境影响评估已完成。计划建设公路4.141公里，铁路5公里，电力供应15兆瓦，通讯网络4.14公里。入区企业将面向：金属加工、非金属矿产品、机器制造、车辆、电子和光学仪器、食品加工、服装和纺织品、木材加工、家具生产、建筑业、运输业、印刷出版业等领域。
2、帕尼韦日斯自由经济区面积47公顷，经济特区规划和环境影响评估已完成。现有公路1.8公里，铁路线经过园区。入区企业将面向：金属加工、建筑、橡胶和塑料、非金属矿产品、电子和光学工业、车辆配件生产、机器和仪器生产、食品加工、服装和纺织品、化学工业等领域。
3、凯代尼艾自由经济区位于考纳斯地区，面积131公顷，经济特区规划和环境影响评估已完成。目前有1.57公里公路（计划再建2.89公里），1.2公里铁路。入区企业将面向：化工、橡胶塑料、金属加工、运输、车辆制造、服装和纺织品、木材、机器设备、建筑和食品加工业等领域。
4、马里亚姆波列自由经济区面积78公顷，经济特区规划和环境影响评估已完成。计划建设公路2.8公里，还将建设铁路，有输电线路10千瓦，燃气网5.8公里，电信网络5.92公里。入区企业将面向：金属加工、机器和仪器制造、服装和纺织品、食品加工、木材工业、非金属矿产品、车辆制造和建筑业等领域。
5、阿克米亚内自由经济区位于首莱地区北部，面积99公顷，经济特区规划和环境影响评估已完成。公路、饮用水和污水设施和铁路尚未规划。入区企业将面向：化工、机器和仪器制造、车辆装配、橡胶和塑料、非金属矿产品、食品加工、木材加工、家具制造、建筑和运输等领域。